新疆冠農(nóng)果茸股份有限公司是由新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團農(nóng)業(yè)建設(shè)第二師二十八團、二十九團、三十團、農(nóng)二師永興供銷有限責(zé)任公司、農(nóng)二師天潤農(nóng)業(yè)生產(chǎn)資料有限責(zé)任公司五家國有法人單位于1999年12月30日聯(lián)合發(fā)起設(shè)立的股份有限公司。2003年5月26日經(jīng)中國證監(jiān)會核準，成功發(fā)行了4000萬社會公眾股，募集資金2.16億元。2004年6月，公司實施資本公積每10股轉(zhuǎn)增5股方案，公司總股本由12000萬股增至18000萬股。2008年3月，公司實施資本公積每10股轉(zhuǎn)增3股方案，公司總股本由18000萬股增至23400萬股。
2004年，公司被國家農(nóng)業(yè)部等八部委確認為“農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)化國家重點龍頭企業(yè)”;2005年，被兵團評為“兵團農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)化經(jīng)營優(yōu)秀龍頭企業(yè)”; 2006年，被國家林業(yè)局確認為“林業(yè)產(chǎn)業(yè)化龍頭企業(yè)”;2006年11月，被國家商務(wù)部確認為“雙百市場工程”流通企業(yè)。
公司目前擁有7個控股子公司、2個參股公司。7個控股子公司分別為：新疆冠農(nóng)果蔬食品有限責(zé)任公司，巴州冠農(nóng)棉業(yè)有限責(zé)任公司，新疆綠原糖業(yè)有限公司，新疆冠農(nóng)天府房地產(chǎn)開發(fā)有限公司，庫爾勒冠農(nóng)綠城果業(yè)有限責(zé)任公司，新疆冠農(nóng)進出口有限公司，新疆冠農(nóng)科技有限公司。2個參股公司為：國投新疆羅布泊鉀鹽有限責(zé)任公司（冠農(nóng)股份持有20.3%的股權(quán)）、國電新疆開都河流域水電開發(fā)有限公司（冠農(nóng)股份持有25%的股權(quán)）。
2008年5月21日，公司向5家特定對象的境內(nèi)投資者以58元/股非公開發(fā)行股票740萬股，實際募集資金4.09億元。每股58元（以1.8億股復(fù)權(quán)發(fā)行價為75.4元/股），創(chuàng)中國證券市場非公開發(fā)行價之最，表明資本市場對冠農(nóng)股份的充分信任，對冠農(nóng)股份產(chǎn)業(yè)發(fā)展的信心。募集資金到位后，冠農(nóng)股份將投資17361萬元參與國投羅鉀增資擴股用于補充120萬噸鉀肥項目建設(shè)資本金，投資8375萬元參與開都河水電公司增資擴股，用于補充察汗烏蘇30萬KW水電站項目建設(shè)資本金，投資6356萬元對全資子公司綠原糖業(yè)增資，用于3萬噸酒精技術(shù)改造項目，投資8000萬元用于補充公司流動資金。
冠農(nóng)股份上市后，依托新疆豐富的果蔬資源、礦產(chǎn)、水電資源，積極融入到優(yōu)勢資源轉(zhuǎn)換戰(zhàn)略中去，構(gòu)建了以果蔬加工、甜菜制糖、棉花加工為主體的農(nóng)業(yè)資源開發(fā)板塊和以鉀鹽開發(fā)、開都河水電開發(fā)為主體的礦產(chǎn)、水電資源開發(fā)板塊，形成了超常規(guī)、跨越式發(fā)展的產(chǎn)業(yè)格局。增發(fā)項目的完成，將為冠農(nóng)股份的產(chǎn)業(yè)發(fā)展奠定堅實的基礎(chǔ)，促冠農(nóng)產(chǎn)業(yè)騰飛。